Le film devrait débuter son histoire dans une petite ville des Etats-Unis. Plusieurs agents du FBI enquêtent sur le docteur Donarra, une sorte de génie à la Frankenstein dont les domaines de prédilection sont la biologie humaine et la biologie extraterrestre.
Le premier temps fort du film sera consacré à une prise d’otages dans une agence de voyage. Les agents Winlock, Darby et Plummer, ce dernier étant une sorte de Mulder, auront à négocier avec un illuminé persuadé que les extraterrestres existent. Parmi les nouveaux personnages, il y aura également l’agent Samantha Pitney et Robert Coe, un policier médium enquêtant sur la disparition d’une enfant et lui-même soupçonné d’avoir tué son propre enfant.